Derivado del mal funcionamiento con que operan las plantas de tratamiento como la ubicada en el poblado de Acapantzingo, fuertes niveles de contaminación se han aunado al Río Apatlaco, pues prácticamente se vierten aguas negras al cauce.
El Biólogo Eduardo Aranda, integrante del Consejo de Barrancas, precisó que dichas plantas no han recibido el mantenimiento adecuado y ello provoca que las aguas residuales no se filtren y se vierten directamente en el cauce. Pidieron por ello a las autoridades estatales realizar trabajos de mantenimiento y rehabilitación de las plantas, y con ello evitar la contaminación de 300 litros por minuto en el río Apatlaco. De acuerdo a autoridades, en Morelos operan 52 de las 61 que existen en el territorio morelense.Operan con deficiencias plantas de tratamiento
